微小 RNA 定序


Cat. No. / ID: RNASeq_Small RNA-Seq  

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Small RNA 長度約 18-30 nt,主要功能為調控生物體之轉錄後修飾,利用序列專一性的基因沉默作用 (RNA silencing) 調節基因表現,進而調控細胞生長發育與生理過程。此法用來發現新的 miRNA、偵測 miRNA 表現量、預測 miRNA 所調控的基因位置 (gene target site)。

基米特色:

  1. 全程 Made in Taiwan
  2. 採用QIAGEN建庫試劑與Illumina定序試劑
  3. 專業生物資訊人員結題服務

樣品來源除了Total RNA外,也可執行微量Exosome small RNA定序

標準分析內容:
1. 原始數據品管 (Quality Filtering)
2. miRNA 表現量偵測 (miRNA Expression)
3. miRNA 表現差異 (miRNA Differential Expression)
4. 標靶基因預測 (Target Prediction)
5. 基因功能的差異表現
-GO 富集分析
-KEGG 富集分析

物種限制:請提供物種學名,需存在於miRbase資料庫中

真核生物-樣品類型 定量分析 定性分析
體積(μl) 總量(μg) 濃度(ng/μl) Fragment Analyzer
Total RNA of Human, Rat, Mice ≥ 20 ≥ 0.5 ≥ 20 RQN ≥ 7.0

定序平台:NovaSeq, 75SE
數據量:≥ 20M reads/sample;可視需求加高數據量