全基因體定序

全基因體定序

Cat. No. / ID: DNAR_Whole Genome Sequencing  

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針對已有參考序列之 DNA 進行重定序，以了解樣本中該序列組成或變異狀況，如 SNV、INDEL 與 SV 的偵測。可用於人類遺傳疾病、癌症等研究，也可應用於動植物分子育種計畫。

基米特色：

  1. 全程 Made in Taiwan
  2. 採用 Illumina 原廠試劑進行Shotgun建庫與定序
  3. 專業生物資訊人員結題服務

  • 標準分析內容：
  1. 原始數據品管 (Reads Quality Filtering)
  2. Reads Mapping
  3. 變異點偵測 (Variant Calling)
  4. 變異點註解 (Variant Annotation)
  • 依組裝策略分成三種流程：
  1. Whole genome re-sequencing (variant calling)
  2. Whole genome assembly
  3. Whole genome assembly and genome comparison
樣品類型 體積(μl) 總量(μg) 濃度(ng/μl) OD260/280 OD260/230
Genomic DNA ≥ 20  ≥ 0.5 ≥ 10  1.8 - 2.2 ≥ 2.0
Genomic DNA (for PCR-free) ≥ 20  ≥ 2 ≥ 40 1.8 - 2.2 ≥ 2.0

 

  • 定序平台：NovaSeq, 150PE
  • 數據量： 深度建議 30X coverage