長鍊非編碼RNA定序
LncRNA 是長度大於 200 nt 且不具有蛋白質編碼資訊的 RNA。將 Total RNA 移除 rRNA 後進行建庫，可同時獲得 poly-A tail mRNA 和 Non-poly-A tail RNA 之定序結果。此法用來鑑定新的lncRNA，研究 lncRNA 在基因轉錄調控、發育以及疾病的發展過程之參與角色。
基米特色：
- 全程 Made in Taiwan
- 採用 Illumina 原廠試劑進行建庫與定序
- 專業生物資訊人員結題服務
利用Ribo-Zero執行rRNA Depletion，利用磁珠法將rRNA洗去，因此留下的RNA則是具有高度研究興趣的RNA種類：mRNA, lincRNA等。因Ribo-Zero具有物種選擇性，基米目前可執行 Human, Mouse, Rat的樣品；採用鍊特異性建庫方式 (Strand-specific)。
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標準分析內容：
1. 原始數據品管 (Quality Filtering)
2. 基因作圖 (Genome Mapping)
3. 結構預測 (Structure)
4. lncRNA Identification
5. 定量分析 (Quantification)
6. 功能預測 (lncRNA Function)
7. 表現差異 (Differential Expression)
| 真核生物－樣品類型 | 定量分析 | 定性分析 | ||
| 體積(μl) | 總量(μg) | 濃度(ng/μl) | Fragment Analyzer | |
| Total RNA of Human, Rat, Mice | ≥ 20 | ≥ 1 | ≥ 100 | RQN ≥ 6.5 |
定序平台：NovaSeq, 150PE
數據量：≥ 20M reads/sample；可視需求加高數據量