人類目標區域甲基化定序

人類目標區域甲基化定序

Cat. No. / ID: DNAM_Target Methylation Sequencing  

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表觀遺傳學是人類基因體研究中迅速發展的領域，DNA甲基化現象可調控轉錄，進而影響基因表達。目前已知許多人類疾病的生成皆與表觀遺傳修飾有密切的關係，如各種癌症、胚胎發育及神經學疾病等。有別於過去經常使用Bisulfite將基因體中未甲基化修飾的胞嘧啶C轉化為尿嘧啶U的Whole Genome Bisulfite Sequencing，基龍米克斯利用酵素法進行轉換，大大降低Bisulfite對於DNA造成的損傷。

基米特色：

  1. 全程 Made in Taiwan
  2. 採用 Twist NGS Methylation Detection System 試劑進行建庫與定序
  3. 使用Enzymatic conversion取代傳統Bisulfite方法，避免DNA受到損傷 

使用Twist NGS Methylation Detection System，針對人類基因體進行複雜的探針設計，同時達到高靈敏度以及高低甲基化區域的均勻覆蓋度。並且分析超過3.98 M CpG位點，覆蓋人類基因體約84% CpG island，其中涵蓋多種不同類型的差異甲基化區域 (Differentially methylated region)，包括CpG islands, shores, shelves以及open seas等。

  • 標準分析內容：
  1. 原始數據品管 (Reads Quality Filtering)
  2. 甲基化偵測 (Methylation level calling)
  3. 甲基化差異結果 (Differentially Methylation Result)
  4. 甲基化註解 (Methylation Annotation)
    －GO 富集分析
    －KEGG 富集分析
樣品類型 體積(μl) 總量(μg) 濃度(ng/μl) OD260/280 OD260/230
Genomic DNA ≥ 20  ≥ 0.5 ≥ 10  1.8 - 2.2 ≥ 2.0
  • 物種 : Human
  • 送樣數量 : 4-plex或其倍數
  • 定序平台：NovaSeq, 150PE
  • 數據量： 建議深度 200X (25G)