Cellplex
先將各組樣品做組別標記後混樣上機，在高通量單細胞檢測平台上同時分析不同組別的基因序列。*僅限搭配3' single cell RNA-seq
- 最多可進行12-plex混樣，大幅降低單一樣品實驗成本。
- 採用特殊組別標記技術，樣品來源不受物種限制。
- 細胞及細胞核皆適用，增加實驗的便利性。
Cell multiplexing oligos (CMOs)
為一段尾端接上lipid molecule的序列，包含能與gel bead序列互補的capture sequence 2、標記組別的feature barcode以及後續建庫用的Read 2N sequence；而lipid molecule能直接鑲嵌到細胞膜上，使組別標記不受物種的限制。
Double libraries construction
在GEM中，Gel bead上的poly(dT)會與mRNA的ploy-A互補，經反轉錄作用合成帶有10x barcode的cDNA，同時capture sequence 2也會與CMO上的capture sequence 2互補，擴增出帶有10x barcode與feature barcode的序列。透過兩組建庫定序、10x barcode交叉比對得知單顆細胞的基因表現以及所屬組別來源。
- Sample preparation 需自行製備，可點擊參考demonstrated protocol
- 基米人員會於現場進行部分流程，屆時請實驗室準備相關設備及耗材。
- 待新鮮細胞懸浮液製備完成後，現場交由基米人員進行Cell QC、cellplex組別標定及GEM包覆。
- 新鮮細胞懸浮液、PBMC、裂解後組織細胞 *所有樣品需同時製備完成
- Cell viability >90%
- Cell concentration：1300-1600 cells/μl
- Cell amount >10^5 cells/sample
定序深度建議：Feature barcode > 5,000 reads/cell、3' RNA Library> 20,000 reads/cell