微小 RNA 定序

Small RNA 長度約 18-30 nt,主要功能為調控生物體之轉錄後修飾,利用序列專一性的基因沉默作用 (RNA silencing) 調節基因表現,進而調控細胞生長發育與生理過程。此法用來發現新的 miRNA、偵測 miRNA 表現量、預測 miRNA 所調控的基因位置 (gene target site)。
基米特色:
- 全程 Made in Taiwan
- 採用QIAGEN建庫試劑與Illumina定序試劑
- 專業生物資訊人員結題服務
樣品來源除了Total RNA外,也可執行微量Exosome small RNA定序
標準分析內容:
1. 原始數據品管 (Quality Filtering)
2. miRNA 表現量偵測 (miRNA Expression)
3. miRNA 表現差異 (miRNA Differential Expression)
4. 標靶基因預測 (Target Prediction)
5. 基因功能的差異表現
-GO 富集分析
-KEGG 富集分析
物種限制:請提供物種學名,需存在於miRbase資料庫中
真核生物-樣品類型 | 定量分析 | 定性分析 | ||
體積(μl) | 總量(μg) | 濃度(ng/μl) | Fragment Analyzer | |
Total RNA of Human, Rat, Mice | ≥ 20 | ≥ 0.5 | ≥ 20 | RQN ≥ 7.0 |
定序平台:NovaSeq, 75SE
數據量:≥ 20M reads/sample;可視需求加高數據量