高品質全基因體定序
針對無參考序列的非模式物種或特殊品系模式物種，透過全基因體定序進行基因體組裝，產生高品質參考基因組，幫助研究人員進行後續更深入的研究，如育種、生命科學研究…等。
推薦採用 PacBio HiFi sequencing 長片段且高品質定序，進行基因體組裝，可達到高品質的參考基因組。完全不再需要 NGS 數據校正！並可偵測結構變異 (Structural Variations, SVs)，例如：SNVs (1≥bp)、Indels (<50bp)、SVs ( ≥50 bp)。
技術優勢：
1. HiFi reads (High-Fidelity reads) 提供高準確度且長讀長之序列，其準確度高達 QV30 (99.9%)
2. 產生具有成為參考文獻的組裝結果 (Reference-quality assemblies) ，提供高品質全基因體組裝。
3. 目前動植物基因體組裝 N50 > 1Mb 已超過 300 個物種。
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標準分析內容：
1. 原始數據品管 (Reads Quality Filtering)
2. 基因體組裝 (Genome Assembly)
| 建庫項目 | 建議平台 | 總量 (μg) | Qubit/Nanodrop (Q/N) Ratio | 體積 (μl) | 濃度 (ng/μl) | OD260/280 | OD260/230 |
| HiFi建庫 (10 –18 kb) | Sequel IIe | ≥ 10 | ≥ 0.5 | ≥20 | ≥ 200 | 1.8-2.0 | ≥ 2.0 |
- 定序平台：Sequel IIe
- 數據量：Q20, 1.5 M reads/ Q30, 1 M reads
使用 HiFi Reads 進行 de Novo Assembly 已是黃金標準，使用兼具高準確度與長片段，不僅可跨越基因體中重複序列，使複雜型或多倍體的基因 體組裝不再是難事。
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