目標區域定序
設計目標區域引子對 (Specific Target Region Primers) 來進行目標區域基因放大與定序，進行大量樣品的目標區域研究。透過 PCR 或 Probe 捕獲方式建庫，可搭配商業化試劑組，進行特定區域之 Structural variant detection、Minor variant detection、SNPs…等研究。
基米特色：
- 可依據實驗目的選擇合適的策略進行目標區域放大，最常見為採用PCR方式，另外也可使用商業化試劑組，例如：Qiagen Panel、Illumina AmpliSeq Panel、Illumina TruSight Panel 等。
- 可依據實驗數據需求選擇合適的定序平台。
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| 樣品類型 | 體積 (μl) | 總量 (ng) | 濃度 (ng/μl) | OD260/280 | OD260/230 | 備註 | |
| PCR-based Amplicon | Amplicon with Barcode | ≥20 | ≥ 100 | ≥ 5 | 1.8-2.2 | ≥ 2.0 | 建議客戶自行混樣成一管 |
| Amplicon with Nextera linker | ≥20 | ≥ 100 | ≥ 5 | 1.8-2.2 | ≥ 2.0 | ||
| Targeted DNA Cancer Panel | Genomic DNA | ≥20 | ≥ 0.2 | ≥ 6 | N/A | N/A | Resuspended in DNase-free water |
| FFPE DNA | ≥20 | ≥ 0.2 | ≥ 6 | N/A | N/A |
1. 通常建議 > 500X/amplicon。
2. 可依數據量需求選擇定序平台：MiSeq / NovaSeq；請洽詢當區業務。