Universal 3' Gene Expression
獨家專利的10x GEM-X Technology讓每顆細胞標註獨特的barcode，以高通量方式分析單顆細胞的基因序列。
- 建庫試劑與晶片再升級，單次實驗可捕獲最大細胞數提升至20,000顆，同時也增加細胞捕捉效率與靈敏度。
- 偵測每顆細胞的個別基因表現，鑑別罕見的細胞類型；揭示細胞異質性，可應用於腫瘤微環境、胚胎發育、神經退化性疾病等研究。
- 可搭配Feature barcode technology，同時評估細胞膜表面蛋白(Cell surface protein)，增加對細胞分群的見解。
GEM (gel bead-in-emulsion)
為油滴包裹的微滴構造，內含一顆細胞與一顆凝珠膠體(gel bead)，經反轉錄作用合成帶有專一barcode的cDNA fragment。GEM可使來自同顆細胞的基因序列均帶有相同barcode，提供分析的細胞標記。
Single Cell 3' v4 Gel Bead
每顆gel bead表面有上百萬條oligo序列，包含後續建庫用的TruSeq Read 1 sequence、標定細胞來源的10x barcode (10x BC)、定量用的unique molecular identifier (UMI)，及與mRNA互補的poly(dT) VN。在GEM中，poly(dT)會與細胞內mRNA的poly(A)互補配對，藉由反轉錄作用合成帶有10x barcode序列的cDNA。
- Sample preparation 需自行製備，可點擊參考demonstrated protocol
- 基米人員會於現場進行部分流程，屆時請實驗室準備相關設備及耗材。
- 待新鮮細胞懸浮液製備完成後，現場交由基米人員進行Cell QC及GEM包覆。
- 新鮮細胞懸浮液、PBMC、裂解後組織細胞
- Cell viability >70% (90%尤佳)
- Cell concentration：1300-1600 cells/μl
- Cell volume >200 μl
定序深度建議：> 20,000 reads/cell